后，冯异作为一军主将，在平定王郎叛乱时立下汗马功劳。由于闲时众将都喜欢围在一起各自吹嘘自己的功绩，唯有冯异独自一人坐在大树下不去炫耀，被将士们戏称为大树将军。

平定王郎后，刘秀命冯异镇守河内防御朱鲔的三十万大军（今河南省北部地区），趁着朱鲔攻打赤眉之时，冯异为了不让李轶出兵干涉，于是暗中示好李轶，并趁机攻克成皋以东十三县（今河南省郑州市及开封市大部分地区）。朱鲔被赤眉击败后，渡过黄河攻打冯异。冯异识破了朱鲔的佯攻之计，于是将计就计大破朱鲔，随后率军南下，绕洛阳一周而归（今河南省洛阳市境内），从此洛阳震恐，朱鲔不敢再有任何动作，直至投降刘秀，也没能跨出洛阳半步。

刘秀迁都洛阳后，由于西线的邓禹在对战赤眉军的过程中屡战屡败，于是刘秀命冯异带兵去西线并接替了邓禹西线统帅一职。冯异率领大军进入西线，先后击溃延岑及不肯降汉的割据势力，并于渑池（今河南省三门峡市境内）击溃赤眉军主力，刘秀称赞曰：“始随垂翅回溪，终能奋翼渑池，可谓失之东隅，收之桑榆”。

击溃赤眉主力后，冯异回师关中，先后击溃李玉、延岑，并将关中全境收复。随后冯异于关中屯田防御公孙述的同时，也震慑了隗嚣，使其不敢妄动。

在讨伐隗嚣的战役中，带甲六十万的冯异成为了汉军西线绝对的主力，在分兵抵御公孙述入侵的同时，还能调集三十万大军攻打隗嚣。冯异大军不但一路势如破竹，兵封直抵隗嚣国都，还震慑了蠢蠢欲动的卢芳，使其不敢乱中取利。

可这员刘秀最倚重的上将军，汉军最杰出的大兵团统帅，却在汉军第二次伐陇战役中，由于至交铁源的阵亡，怒火攻心，于营中暴亡，化作东方青龙第七星箕水豹俯瞰人间。

喜欢刘秀：左手雄兵，右手流星！。